Как найти кодоны рнк

И транскрипция, и трансляция относятся к матричным биосинтезам. Матричным биосинтезом называется синтез
биополимеров (нуклеиновых кислот, белков) на матрице – нуклеиновой кислоте ДНК или РНК. Процессы матричного биосинтеза относятся к пластическому обмену: клетка расходует энергию АТФ.

Матричный синтез можно представить как создание копии исходной информации на несколько другом или новом
“генетическом языке”. Скоро вы все поймете – мы научимся достраивать по одной цепи ДНК другую, переводить РНК в ДНК
и наоборот, синтезировать белок с иРНК на рибосоме. В данной статье вас ждут подробные примеры решения задач, генетический словарик пригодится – перерисуйте его себе 🙂

Перевод РНК в ДНК

Возьмем 3 абстрактных нуклеотида ДНК (триплет) – АТЦ. На иРНК этим нуклеотидам будут соответствовать – УАГ (кодон иРНК).
тРНК, комплементарная иРНК, будет иметь запись – АУЦ (антикодон тРНК). Три нуклеотида в зависимости от своего расположения
будут называться по-разному: триплет, кодон и антикодон. Обратите на это особое внимание.

Репликация ДНК – удвоение, дупликация (лат. replicatio — возобновление, лат. duplicatio – удвоение)

Процесс синтеза дочерней молекулы ДНК по матрице родительской ДНК. Нуклеотиды достраивает фермент ДНК-полимераза по
принципу комплементарности. Переводя действия данного фермента на наш язык, он следует следующему правилу: А (аденин) переводит в Т (тимин), Г (гуанин) – в Ц (цитозин).

Репликация ДНК

Удвоение ДНК происходит в синтетическом периоде интерфазы. При этом общее число хромосом не меняется, однако каждая из них
содержит к началу деления две молекулы ДНК: это необходимо для равномерного распределения генетического материала между
дочерними клетками.

Транскрипция (лат. transcriptio — переписывание)

Транскрипция представляет собой синтез информационной РНК (иРНК) по матрице ДНК. Несомненно, транскрипция происходит
в соответствии с принципом комплементарности азотистых оснований: А – У, Т – А, Г – Ц, Ц – Г (загляните в “генетический словарик”
выше).

Транскрипция

До начала непосредственно транскрипции происходит подготовительный этап: фермент РНК-полимераза узнает особый участок молекулы ДНК – промотор и связывается с ним. После связывания с промотором происходит раскручивание молекулы ДНК, состоящей из двух
цепей: транскрибируемой и смысловой. В процессе транскрипции принимает участие только транскрибируемая цепь ДНК.

Транскрипция осуществляется в несколько этапов:

  • Инициация (лат. injicere — вызывать)
  • Образуется несколько начальных кодонов иРНК.

  • Элонгация (лат. elongare — удлинять)
  • Нити ДНК последовательно расплетаются, освобождая место для передвигающейся РНК-полимеразы. Молекула иРНК
    быстро растет.

  • Терминация (лат. terminalis — заключительный)
  • Достигая особого участка цепи ДНК – терминатора, РНК-полимераза получает сигнал к прекращению синтеза иРНК. Транскрипция завершается. Синтезированная иРНК направляется из ядра в цитоплазму.

Фазы транскрипции

Трансляция (от лат. translatio — перенос, перемещение)

Куда же отправляется новосинтезированная иРНК в процессе транскрипции? На следующую ступень – в процесс трансляции.
Он заключается в синтезе белка на рибосоме по матрице иРНК. Последовательность кодонов иРНК переводится в последовательность
аминокислот.

Трансляция

Перед процессом трансляции происходит подготовительный этап, на котором аминокислоты присоединяются к соответствующим молекулам тРНК. Трансляцию можно разделить на несколько стадий:

  • Инициация
  • Информационная РНК (иРНК, синоним – мРНК (матричная РНК)) присоединяется к рибосоме, состоящей из двух субъединиц.
    Замечу, что вне процесса трансляции субъединицы рибосом находятся в разобранном состоянии.

    Первый кодон иРНК, старт-кодон, АУГ оказывается в центре рибосомы, после чего тРНК приносит аминокислоту,
    соответствующую кодону АУГ – метионин.

  • Элонгация
  • Рибосома делает шаг, и иРНК продвигается на один кодон: такое в фазу элонгации происходит десятки тысяч раз.
    Молекулы тРНК приносят новые аминокислоты, соответствующие кодонам иРНК. Аминокислоты соединяются друг с другом: между ними образуются пептидные связи, молекула белка растет.

    Доставка нужных аминокислот осуществляется благодаря точному соответствию 3 нуклеотидов (кодона) иРНК 3 нуклеотидам (антикодону) тРНК. Язык перевода между иРНК и тРНК выглядит как: А (аденин) – У (урацил), Г (гуанин) – Ц (цитозин).
    В основе этого также лежит принцип комплементарности.

    Трансляция

    Движение рибосомы вдоль молекулы иРНК называется транслокация. Нередко в клетке множество рибосом садятся на одну молекулу
    иРНК одновременно – образующаяся при этом структура называется полирибосома (полисома). В результате происходит одновременный синтез множества одинаковых белков.

    Полисома

  • Терминация
  • Синтез белка – полипептидной цепи из аминокислот – в определенный момент завершатся. Сигналом к этому служит попадание
    в центр рибосомы одного из так называемых стоп-кодонов: УАГ, УГА, УАА. Они относятся к нонсенс-кодонам (бессмысленным), которые не кодируют ни одну аминокислоту. Их функция – завершить синтез белка.

Существует специальная таблица для перевода кодонов иРНК в аминокислоты. Пользоваться ей очень просто, если вы запомните, что
кодон состоит из 3 нуклеотидов. Первый нуклеотид берется из левого вертикального столбика, второй – из верхнего горизонтального,
третий – из правого вертикального столбика. На пересечении всех линий, идущих от них, и находится нужная вам аминокислота 🙂

Таблица генетического кода

Давайте потренируемся: кодону ЦАЦ соответствует аминокислота Гис, кодону ЦАА – Глн. Попробуйте самостоятельно найти
аминокислоты, которые кодируют кодоны ГЦУ, ААА, УАА.

Кодону ГЦУ соответствует аминокислота – Ала, ААА – Лиз. Напротив кодона УАА в таблице вы должны были обнаружить прочерк:
это один из трех нонсенс-кодонов, завершающих синтез белка.

Примеры решения задачи №1

Без практики теория мертва, так что скорее решим задачи! В первых двух задачах будем пользоваться таблицей генетического кода (по иРНК),
приведенной вверху.

“Фрагмент цепи ДНК имеет следующую последовательность нуклеотидов: ЦГА-ТГГ-ТЦЦ-ГАЦ. Определите последовательность нуклеотидов
во второй цепочке ДНК, последовательность нуклеотидов на иРНК, антикодоны
соответствующих тРНК и аминокислотную последовательность соответствующего фрагмента молекулы белка, используя таблицу генетического кода”

Задача на транскрипцию и трансляцию

Объяснение:

По принципу комплементарности мы нашли вторую цепочку ДНК: ГЦТ-АЦЦ-АГГ-ЦТГ. Мы использовали следующие правила при нахождении второй нити
ДНК: А-Т, Т-А, Г-Ц, Ц-Г.

Вернемся к первой цепочке, и именно от нее пойдем к иРНК: ГЦУ-АЦЦ-АГГ-ЦУГ. Мы использовали следующие правила при переводе ДНК в иРНК:
А-У, Т-А, Г-Ц, Ц-Г.

Зная последовательность нуклеотидов иРНК, легко найдем тРНК: ЦГА, УГГ, УЦЦ, ГАЦ. Мы использовали следующие правила перевода иРНК в тРНК:
А-У, У-А, Г-Ц, Ц-Г. Обратите внимание, что антикодоны тРНК мы разделяем запятыми, в отличие кодонов иРНК. Это связано с тем, что
тРНК представляют собой отдельные молекулы (в виде клеверного листа), а не линейную структуру (как ДНК, иРНК).

Пример решения задачи №2

“Известно, что все виды РНК синтезируются на ДНК-матрице. Фрагмент цепи ДНК, на которой синтезируется участок центральной петли тРНК, имеет
следующую последовательность нуклеотидов: ТАГ-ЦАА-АЦГ-ГЦТ-АЦЦ. Установите нуклеотидную последовательность участка тРНК, который синтезируется
на данном фрагменте, и аминокислоту, которую будет переносить эта тРНК в процессе биосинтеза белка, если третий триплет соответствует антикодону
тРНК”

Задача на транскрипцию и трансляцию

Обратите свое пристальное внимание на слова “Известно, что все виды РНК синтезируются на ДНК-матрице. Фрагмент цепи ДНК, на которой
синтезируется участок центральной петли тРНК “. Эта фраза кардинально меняет ход решения задачи: мы получаем право напрямую и сразу
синтезировать с ДНК фрагмент тРНК – другой подход здесь будет считаться ошибкой.

Итак, синтезируем напрямую с ДНК фрагмент молекулы тРНК: АУЦ-ГУУ-УГЦ-ЦГА-УГГ. Это не отдельные молекулы тРНК (как было
в предыдущей задаче), поэтому не следует разделять их запятой – мы записываем их линейно через тире.

Третий триплет ДНК – АЦГ соответствует антикодону тРНК – УГЦ. Однако мы пользуемся таблицей генетического кода по иРНК,
так что переведем антикодон тРНК – УГЦ в кодон иРНК – АЦГ. Теперь очевидно, что аминокислота кодируемая АЦГ – Тре.

Пример решения задачи №3

Длина фрагмента молекулы ДНК составляет 150 нуклеотидов. Найдите число триплетов ДНК, кодонов иРНК, антикодонов тРНК и
аминокислот, соответствующих данному фрагменту. Известно, что аденин составляет 20% в данном фрагменте (двухцепочечной
молекуле ДНК), найдите содержание в процентах остальных нуклеотидов.

Задача на транскрипцию и трансляцию

Один триплет ДНК состоит из 3 нуклеотидов, следовательно, 150 нуклеотидов составляют 50 триплетов ДНК (150 / 3). Каждый триплет ДНК
соответствует одному кодону иРНК, который в свою очередь соответствует одному антикодону тРНК – так что их тоже по 50.

По правилу Чаргаффа: количество аденина = количеству тимина, цитозина = гуанина. Аденина 20%, значит и тимина также 20%.
100% – (20%+20%) = 60% – столько приходится на оставшиеся цитозин и гуанин. Поскольку их процент содержания равен, то
на каждый приходится по 30%.

Теперь мы украсили теорию практикой. Что может быть лучше при изучении новой темы? 🙂

© Беллевич Юрий Сергеевич 2018-2023

Данная статья написана Беллевичем Юрием Сергеевичем и является его интеллектуальной собственностью. Копирование, распространение
(в том числе путем копирования на другие сайты и ресурсы в Интернете) или любое иное использование информации и объектов
без предварительного согласия правообладателя преследуется по закону. Для получения материалов статьи и разрешения их использования,
обратитесь, пожалуйста, к Беллевичу Юрию.

Скачать материал

без ожидания

Решение задач с использованием таблицы генетического кода

Скачать материал

без ожидания

  • Сейчас обучается 20 человек из 9 регионов

  • Сейчас обучается 26 человек из 19 регионов

  • Сейчас обучается 28 человек из 22 регионов

Описание презентации по отдельным слайдам:

  • Решение задач с использованием таблицы генетического кода

    1 слайд

    Решение задач с использованием таблицы генетического кода

  • Повторение:
Какие процессы описаны в данной схеме? Как они взаимосвязаны?

    2 слайд

    Повторение:
    Какие процессы описаны в данной схеме? Как они взаимосвязаны?

  • В одной цепи молекулы ДНК следующая последовательность нуклеотидов: ТТАААЦЦАТ...

    3 слайд

    В одной цепи молекулы ДНК следующая последовательность нуклеотидов: ТТАААЦЦАТТТГ.
    Используя принцип комплементарности, постройте вторую цепь и и-РНК, комплементарную ей.
    -Т – Т – А – А- А – Ц – Ц- А- Т- Т – Т – Г –
    I I I I I I I I I I I I
    -А – А – Т – Т – Т- Г – Г – Т – А – А – А – Ц-
    (ДНК)

      -У – У – А –А – А –Ц – Ц – А – У – У –У – Г-
    (и- РНК)

  • Таблица генетического кода (и-РНК)

    4 слайд

    Таблица генетического кода (и-РНК)

  • Основные типы задач, решение которых предполагает использование таблицы генет...

    5 слайд

    Основные типы задач, решение которых предполагает использование таблицы генетического кода
    Построение молекулы и-РНК, антикодонов т-РНК и последовательности аминокислот в белке

    Определение структуры т-РНК и переносимой ею аминокислоты

    Определение аминокислотной последовательности в белке до и после изменений в ДНК

    Краткая теория
    Задача 1
    Задача 2
    Задача 3
    Задача 4
    Задача 5
    Задача 6
    Задача 8
    Задача 7
    Завершить работу
    Краткая теория
    Информационные источники
    самостоятельно:
    самостоятельно:

  • нуклеотиды и-РНК комплементарны нуклеотидам ДНК;
вместо тимина ДНК во всех ви...

    6 слайд

    нуклеотиды и-РНК комплементарны нуклеотидам ДНК;
    вместо тимина ДНК во всех видах РНК записывается урацил;
    нуклеотиды и-РНК пишутся подряд, без запятых, т. к. имеется в виду одна молекула;
    кодон и-РНК комплементарен антикодону т-РНК
    антикодоны т-РНК пишутся через запятую, т. к. каждый антикодон принадлежит отдельной молекуле т-РНК;
    Основной теоретический материал
    Построение молекулы и-РНК, антикодонов т-РНК и последовательности аминокислот в белке

  • аминокислоты находим по таблице генетического кода;
аминокислоты в белке пишу...

    7 слайд

    аминокислоты находим по таблице генетического кода;
    аминокислоты в белке пишутся через дефис, т. к. имеется в виду, что они уже соединились и образовали первичную структуру белка;
    3 нуклеотида =1 триплет (кодон) = 1 аминокислота = 1 т-РНК

    Основной теоретический материал
    Построение молекулы и-РНК, антикодонов т-РНК и последовательности аминокислот в белке

  • аминокислоты находим по таблице генетического кода;
аминокислоты в белке пишу...

    8 слайд

    аминокислоты находим по таблице генетического кода;
    аминокислоты в белке пишутся через дефис, т. к. имеется в виду, что они уже соединились и образовали первичную структуру белка;
    3 нуклеотида =1 триплет (кодон) = 1 аминокислота = 1 т-РНК

    Основной теоретический материал
    Построение молекулы и-РНК, антикодонов т-РНК и последовательности аминокислот в белке

  • Задача 1. 
Фрагмент цепи ДНК имеет последовательность 
   А-Ц-Г-Т-Т-Г-Ц-Ц-Ц...

    9 слайд

    Задача 1.
    Фрагмент цепи ДНК имеет последовательность
    А-Ц-Г-Т-Т-Г-Ц-Ц-Ц-А-А-Т.
    Определите последовательность нуклеотидов и-РНК, антикодоны т-РНК и последовательность аминокислот в синтезируемом белке.

  • и-РНК строим комплементарно ДНК;
антикодоны т-РНК комплементарны кодонам и-Р...

    10 слайд

    и-РНК строим комплементарно ДНК;
    антикодоны т-РНК комплементарны кодонам и-РНК;
    аминокислоты находим по кодонам и-РНК, используя таблицу генетического кода.
    Основные этапы решения задачи. План рассуждений.

  • фрагмент цепи ДНК:                   
 А-Ц-Г-Т-Т-Г-Ц-Ц-Ц-А-А-Т
кодоны и-РНК:...

    11 слайд

    фрагмент цепи ДНК:
    А-Ц-Г-Т-Т-Г-Ц-Ц-Ц-А-А-Т
    кодоны и-РНК:
    У-Г-Ц-А-А-Ц-Г-Г-Г-У-У-А
    антикодоны т-РНК
    А-Ц-Г,У-У-Г,Ц-Ц-Ц,А-А-У
    Основные этапы решения задачи. Оформление.

  • фрагмент цепи ДНК:                   
 АЦГ-ТТГ-ЦЦЦ-ААТ
кодоны и-РНК:...

    12 слайд

    фрагмент цепи ДНК:
    АЦГ-ТТГ-ЦЦЦ-ААТ
    кодоны и-РНК:
    УГЦ-ААЦ-ГГГ-УУА
    антикодоны т-РНК
    АЦГ,УУГ,ЦЦЦ, ААУ
    Основные этапы решения задачи. Краткое оформление.

  • кодоны и-РНК: УГЦ-ААЦ-ГГГ-УУА

    13 слайд

    кодоны и-РНК: УГЦ-ААЦ-ГГГ-УУА

  • Таблица генетического кода (и-РНК)

    14 слайд

    Таблица генетического кода (и-РНК)

  • последовательность аминокислот в белке: 
              цис-асн-гли-лей
(кодон...

    15 слайд

    последовательность аминокислот в белке:
    цис-асн-гли-лей
    (кодоны и-РНК:
    УГЦ-ААЦ-ГГГ-УУА)

    Основные этапы решения задачи. Определение аминокислот по таблице генетического кода.

  • Задача 2. 
Последовательность аминокислот во фрагменте молекулы белка фен-г...

    16 слайд

    Задача 2.
    Последовательность аминокислот во фрагменте молекулы белка фен-глу-мет.
    Определите, пользуясь таблицей генетического кода, возможные триплеты ДНК, которые кодируют этот фрагмент белка

  • Триплеты и-РНК: Фен-Глу-Мет
Фен – УУУ или УУЦ
Глу – ГАА или ГАГ
Мет - АУГ
Нах...

    17 слайд

    Триплеты и-РНК: Фен-Глу-Мет
    Фен – УУУ или УУЦ
    Глу – ГАА или ГАГ
    Мет – АУГ
    Находим триплеты ДНК:
    Фен – ААА или ААГ
    Глу – ЦТТ или ЦТЦ
    Мет – ТАЦ
    Основные этапы решения задачи. Решение задачи. Оформление.

  • Триплеты и-РНК: Фен-Глу-Мет
Фен – УУУ или УУЦ
Глу – ГАА или ГАГ
Мет - АУГ
Нах...

    18 слайд

    Триплеты и-РНК: Фен-Глу-Мет
    Фен – УУУ или УУЦ
    Глу – ГАА или ГАГ
    Мет – АУГ
    Находим триплеты ДНК:
    Фен – ААА или ААГ
    Глу – ЦТТ или ЦТЦ
    Мет – ТАЦ
    Основные этапы решения задачи. Решение задачи. Оформление.

  • Задача 3. 
В биосинтезе белка участвовали        т-РНК с антикодонами 
 УУА...

    19 слайд

    Задача 3.
    В биосинтезе белка участвовали т-РНК с антикодонами
    УУА, ГГЦ, ЦГЦ, АУА, ЦГУ.
    Определите структуру двухцепочечного участка молекулы ДНК, несущего информацию о синтезируемом полипептиде, и последовательность аминокислот в нем.

  • 


Ответы на задачу № 3

    20 слайд

    Ответы на задачу № 3

  • Задача 4. 
Матрицей для синтеза белка послужил фрагмент и-РНК, имеющий посл...

    21 слайд

    Задача 4.
    Матрицей для синтеза белка послужил фрагмент и-РНК, имеющий последовательность
    АУГ-ГЦУ-ААА-ЦЦГ.
    Определите антикодоны т-РНК, участвовавшие в трансляции, первичную структуру синтезированного белка и последовательность нуклеотидов в гене, кодирующем данный белок.

  • 


Ответы на задачу № 4

    22 слайд

    Ответы на задачу № 4

  • т-РНК синтезируются прямо на матрице ДНК по принципу комплементарности...

    23 слайд

    т-РНК синтезируются прямо на матрице ДНК по принципу комплементарности и без участия и-РНК (обычно это указывается в условии задачи);
    чтобы узнать, какую аминокислоту переносит т-РНК, необходимо построить кодон и-РНК;
    по кодону и-РНК с помощью таблицы генетического кода определяем аминокислоту;
    указанный в условии триплет т-РНК является антикодоном.

    Определение структуры т-РНК и переносимой ею аминокислоты

  • т-РНК синтезируются прямо на матрице ДНК по принципу комплементарности...

    24 слайд

    т-РНК синтезируются прямо на матрице ДНК по принципу комплементарности и без участия и-РНК (обычно это указывается в условии задачи);
    чтобы узнать, какую аминокислоту переносит т-РНК, необходимо построить кодон и-РНК;
    по кодону и-РНК с помощью таблицы генетического кода определяем аминокислоту;
    указанный в условии триплет т-РНК является антикодоном.

    Определение структуры т-РНК и переносимой ею аминокислоты

  • Задача 5. 
Известно, что все виды РНК синтезируются на ДНК - матрице. Фраг...

    25 слайд

    Задача 5.
    Известно, что все виды РНК синтезируются на ДНК – матрице. Фрагмент молекулы ДНК, на которой синтезировался участок центральной петли т-РНК, имеет следующую последовательность нуклеотидов:
    ЦГЦ-ГАЦ-ГТГ-ГТЦ-ГАА.
    Установите нуклеотидную последовательность участка т-РНК, который синтезируется на данном фрагменте, и аминокислоту, которую будет переносить эта т-РНК в процессе биосинтеза белка, если третий триплет соответствует антикодону т-РНК.
    Ответ поясните.

  • 1) Находим последовательность нуклеотидов участка центральной петли т-РНК:...

    26 слайд

    1) Находим последовательность нуклеотидов участка центральной петли т-РНК:
    участок ДНК: ЦГЦ-ГАЦ-ГТГ-ГТЦ-ГАА
    т-РНК: ГЦГ-ЦУГ-ЦАЦ-ЦАГ-ЦУУ
    2) Подчеркнутый триплет по условию задачи соответствует антикодону. Антикодон
    т-РНК: ЦАЦ. Ему соответствует кодон
    и-РНК: ГУГ.
    3) По таблице генетического кода находим аминокислоту: вал.
    Основные этапы решения задачи. План рассуждений. Оформление.

  • 1) Находим последовательность нуклеотидов участка центральной петли т-РНК:...

    27 слайд

    1) Находим последовательность нуклеотидов участка центральной петли т-РНК:
    участок ДНК: ЦГЦ-ГАЦ-ГТГ-ГТЦ-ГАА
    т-РНК: ГЦГ-ЦУГ-ЦАЦ-ЦАГ-ЦУУ
    2) Подчеркнутый триплет по условию задачи соответствует антикодону. Антикодон
    т-РНК: ЦАЦ. Ему соответствует кодон
    и-РНК: ГУГ.
    3) По таблице генетического кода находим аминокислоту: вал.
    Основные этапы решения задачи. План рассуждений. Оформление.

  • Задача 6. 
Известно, что все виды РНК синтезируются на ДНК - матрице. Фраг...

    28 слайд

    Задача 6.
    Известно, что все виды РНК синтезируются на ДНК – матрице. Фрагмент молекулы ДНК, на которой синтезировался участок центральной петли т-РНК, имеет следующую последовательность нуклеотидов:
    АТА­ГЦТ­ГАА- ЦГГ-АЦТ.
    Установите нуклеотидную последовательность участка т-РНК, который синтезируется на данном фрагменте, и аминокислоту, которую будет переносить эта т-РНК в процессе биосинтеза белка, если третий триплет соответствует антикодону т-РНК.
    Ответ поясните.

  • Ответ: 
1) нуклеотидная последовательность участка тРНК: 
  УАУ-ЦГА-ЦУУ-ГЦЦ-У...

    29 слайд

    Ответ:
    1) нуклеотидная последовательность участка тРНК:
    УАУ-ЦГА-ЦУУ-ГЦЦ-УГА;
    2) нуклеотидная последовательность антикодона ЦУУ (третий триплет) соответствует кодону на и-РНК: ГАА;
    3) по таблице генетического кода этому кодону соответствует аминокислота глу, которую будет переносить данная т-РНК
    Условие: Известно, что все виды РНК синтезируются на ДНК – матрице. Фрагмент молекулы ДНК, на которой синтезировался участок центральной петли т-РНК, имеет следующую последовательность нуклеотидов: АТА­ГЦТ­ГАА- ЦГГ-АЦТ

  • Ответ: 
1) нуклеотидная последовательность участка тРНК: 
  УАУ-ЦГА-ЦУУ-ГЦЦ-У...

    30 слайд

    Ответ:
    1) нуклеотидная последовательность участка тРНК:
    УАУ-ЦГА-ЦУУ-ГЦЦ-УГА;
    2) нуклеотидная последовательность антикодона ЦУУ (третий триплет) соответствует кодону на и-РНК: ГАА;
    3) по таблице генетического кода этому кодону соответствует аминокислота глу, которую будет переносить данная т-РНК
    Условие: Известно, что все виды РНК синтезируются на ДНК – матрице. Фрагмент молекулы ДНК, на которой синтезировался участок центральной петли т-РНК, имеет следующую последовательность нуклеотидов: АТА­ГЦТ­ГАА- ЦГГ-АЦТ

  • Оцените себя:

0 ошибок – 3 балла
1 ошибка – 2 балла
2 ошибки – 1 балл

    31 слайд

    Оцените себя:

    0 ошибок – 3 балла
    1 ошибка – 2 балла
    2 ошибки – 1 балл

  • Задача 7. 
   С какой последовательности аминокислот начинается белок, есл...

    32 слайд

    Задача 7.
    С какой последовательности аминокислот начинается белок, если он закодирован такой последовательностью нуклеотидов: ГАЦ-ЦГА-ТГТ-АТГ-АГА.
    Каким станет начало цепочки, если под влиянием облучения четвертый нуклеотид окажется выбитым из молекулы ДНК?
    Как это отразится на свойствах синтезируемого белка?

  • 1) Исходная ДНК: 
     ГАЦ-ЦГА-ТГТ-АТГ-АГА
     и-РНК: 
     ЦУГ-ГЦУ-АЦА-УАЦ-...

    33 слайд

    1) Исходная ДНК:
    ГАЦ-ЦГА-ТГТ-АТГ-АГА
    и-РНК:
    ЦУГ-ГЦУ-АЦА-УАЦ-УЦУ
    последовательность аминокислот:
    лей-ала-тре-тир-сер
    Основные этапы решения задачи. План рассуждений. Оформление.

  • 2) Оставшаяся последовательность будет на один нуклеотид короче, поэтому посл...

    34 слайд

    2) Оставшаяся последовательность будет на один нуклеотид короче, поэтому последний триплет будет неполным. Значит, и последовательность аминокислот будет короче на одну аминокислоту.
    Измененная (мутантная) ДНК:
    ГАЦ-ГАТ-ГТА-ТГА-ГА
    и- РНК: ЦУГ-ЦУА-ЦАУ-АЦУ-ЦУ
    последовательность аминокислот:
    лей-лей-гис-тре-…
    Основные этапы решения задачи. План рассуждений. Оформление.

  • 3)Первичная структура белка изменилась (изменилось число аминокислот и их п...

    35 слайд

    3)Первичная структура белка изменилась (изменилось число аминокислот и их последовательность), что отразится на пространственной структуре молекулы, а значит, и на ее свойствах и функциях.
    Основные этапы решения задачи. План рассуждений. Оформление.

  • Задача 8. 
В результате мутации во фрагменте молекулы белка аминокислота трео...

    36 слайд

    Задача 8.
    В результате мутации во фрагменте молекулы белка аминокислота треонин (тре) заменилась на глутамин (глн).
    Определите аминокислотный состав фрагмента молекулы нормального и мутированного белка и фрагмент мутированной и-РНК, если в норме и-РНК имеет последовательность:
    ГУЦ-АЦА­ГЦГ-АУЦ-ААУ.
    Ответ поясните. Для решения задания используйте таблицу генетического кода.

  • 1) и-РНК: ГУЦ−АЦА-ГЦГ- АУЦ-ААУ; 
нормальный белок: ……………………………………..;
2) После...

    37 слайд

    1) и-РНК: ГУЦ−АЦА-ГЦГ- АУЦ-ААУ;
    нормальный белок: ……………………………………..;
    2) После мутации фрагмент молекулы белка будет иметь состав: ………………………………..;
    3) Глутамин кодируется двумя кодонами …… и ……., следовательно, мутированная и-РНК будет …………………..….. или …………………….……..
    Скорее всего произошла …………………………………
    ………………………., т.е. ….поменялись с …. — триплет …….. превратился в ……. и тогда мутированная и-РНК будет:………………………
    Основные этапы решения задачи. План рассуждений.

  • 1) и-РНК: ГУЦ−АЦА-ГЦГ- АУЦ-ААУ; 
нормальный белок: вал-тре-ала-иле-асн;
2) По...

    38 слайд

    1) и-РНК: ГУЦ−АЦА-ГЦГ- АУЦ-ААУ;
    нормальный белок: вал-тре-ала-иле-асн;
    2) После мутации фрагмент молекулы белка будет иметь состав: вал-глн-ала-иле-асн;
    3) Глутамин кодируется двумя кодонами ЦАА и ЦАГ, следовательно, мутированная и-РНК будет ГУЦ−ЦАА−ГЦГ−АУЦ−ААУ или . ГУЦ−ЦАГ−ГЦГ−АУЦ−ААУ
    Скорее всего произошла инверсия — поворот нуклеотидов на 180°, т.е. А поменялись с Ц — триплет АЦА превратился в ЦАА и тогда мутированная и-РНК будет: ГУЦ−ЦАА−ГЦГ−АУЦ−ААУ

  • 1) и-РНК: ГУЦ−АЦА-ГЦГ- АУЦ-ААУ; 
нормальный белок: вал-тре-ала-иле-асн;
2) По...

    39 слайд

    1) и-РНК: ГУЦ−АЦА-ГЦГ- АУЦ-ААУ;
    нормальный белок: вал-тре-ала-иле-асн;
    2) После мутации фрагмент молекулы белка будет иметь состав: вал-глн-ала-иле-асн;
    3) Глутамин кодируется двумя кодонами ЦАА и ЦАГ, следовательно, мутированная и-РНК будет ГУЦ−ЦАА−ГЦГ−АУЦ−ААУ или . ГУЦ−ЦАГ−ГЦГ−АУЦ−ААУ
    Скорее всего произошла инверсия — поворот нуклеотидов на 180°, т.е. А поменялись с Ц — триплет АЦА превратился в ЦАА и тогда мутированная и-РНК будет: ГУЦ−ЦАА−ГЦГ−АУЦ−ААУ

  • Оцените себя:

0 ошибок – 3 балла
1 ошибка – 2 балла
2 ошибки – 1 балл

    40 слайд

    Оцените себя:

    0 ошибок – 3 балла
    1 ошибка – 2 балла
    2 ошибки – 1 балл

  • Таблица генетического кода (и-РНК)

    41 слайд

    Таблица генетического кода (и-РНК)

  • Список использованных источников
https://ru.wikipedia.org/wiki  – Таблица ген...

    42 слайд

    Список использованных источников
    https://ru.wikipedia.org/wiki – Таблица генетического кода;
    http://bio.reshuege.ru – Задачи по цитологии С5;
    http://ege-study.ru/materialy-ege/podborka-zadanij-po-citologii – Д. А. Соловков, ЕГЭ по биологии, задача С5. Подборка заданий по цитологии;
    http://keramikos.ru/table.php?ap=table1000304 – Задание С5. Решение задач по цитологии на применение знаний в новой;
    http://www.myshared.ru/slide/357298 – Решение задач части С5.

Найдите материал к любому уроку, указав свой предмет (категорию), класс, учебник и тему:

6 251 546 материалов в базе

  • Выберите категорию:

  • Выберите учебник и тему

  • Выберите класс:

  • Тип материала:

    • Все материалы

    • Статьи

    • Научные работы

    • Видеоуроки

    • Презентации

    • Конспекты

    • Тесты

    • Рабочие программы

    • Другие методич. материалы

Найти материалы

Другие материалы

  • 23.11.2016
  • 1208
  • 0
  • 23.11.2016
  • 11805
  • 124
  • 23.11.2016
  • 9936
  • 9
  • 23.11.2016
  • 706
  • 0
  • 23.11.2016
  • 1546
  • 1
  • 23.11.2016
  • 3125
  • 32
  • 23.11.2016
  • 1018
  • 6

Вам будут интересны эти курсы:

  • Курс повышения квалификации «Организация и руководство учебно-исследовательскими проектами учащихся по предмету «Биология» в рамках реализации ФГОС»

  • Курс повышения квалификации «ФГОС общего образования: формирование универсальных учебных действий на уроке биологии»

  • Курс повышения квалификации «Медико-биологические основы безопасности жизнедеятельности»

  • Курс повышения квалификации «Методические аспекты реализации элективного курса «Антропология и этнопсихология» в условиях реализации ФГОС»

  • Курс повышения квалификации «Государственная итоговая аттестация как средство проверки и оценки компетенций учащихся по биологии»

  • Курс повышения квалификации «Нанотехнологии и наноматериалы в биологии. Нанобиотехнологическая продукция»

  • Курс повышения квалификации «Основы биоэтических знаний и их место в структуре компетенций ФГОС»

  • Курс повышения квалификации «Гендерные особенности воспитания мальчиков и девочек в рамках образовательных организаций и семейного воспитания»

  • Курс профессиональной переподготовки «Биология и химия: теория и методика преподавания в образовательной организации»

  • Курс профессиональной переподготовки «Организация производственно-технологической деятельности в области декоративного садоводства»

  • Курс повышения квалификации «Инновационные технологии обучения биологии как основа реализации ФГОС»

Текущая версия страницы пока не проверялась опытными участниками и может значительно отличаться от версии, проверенной 24 апреля 2016 года; проверки требуют 37 правок.

Поток генетической информации.

Сначала ген из 4-символьного алфавита ДНК (A,T,G,C) переписывается с помощью процесса транскрипции в 4-символьный алфавит РНК (A,U,G,C), а из РНК могут быть переведены с помощью процесса трансляции в 20-символьный алфавит аминокислот синтезируемого белка.

Кодо́н (кодирующий тринуклеотид) — единица генетического кода, тройка нуклеотидных остатков (триплет) в ДНК или РНК, обычно кодирующих включение одной аминокислоты. Последовательность кодонов в гене определяет последовательность аминокислот в полипептидной цепи белка, кодируемого этим геном.

Классификация[править | править код]

Поскольку существует 4 различных азотистых основания (аденин, гуанин, цитозин, тимин), а аминокислоты кодируются кодоном, состоящим из комбинаций трёх нуклеотидов, то по законам комбинаторики общее число кодонов равно числу размещений с повторениями: {displaystyle {bar {A}}_{n}^{k}=n^{k}}, {displaystyle {bar {A}}_{4}^{3}=4^{3}=64} комбинации, из которых 61 комбинация кодирует определённые аминокислоты, а 3 оставшихся кодона (UGA, UAG и UAA) сигнализируют об остановке трансляции полипептидной цепи и называются стоп-кодонами.

Стартовым кодоном у эукариотических организмов является триплет AUG в мРНК, кодирующий метионин, с которого начинается образование полипептидной цепи в процессе трансляции.

У некоторых прокариот стартовыми кодонами также являются GUG, AUU, CUG, UUG.

Так как в процессе биосинтеза белка в полипептидную цепь участвует всего 20 аминокислот, то различные кодоны могут кодировать одинаковые аминокислоты, такие кодоны принято называть изоакцепторными кодонами.

Таблица кодонов РНК[править | править код]

неполярный полярный основный кислотный (стоп-кодон)
Стандартный генетический код

1-е
основание
2-е основание 3-е
основание
U C A G
U UUU (Phe/F) Фенилаланин UCU (Ser/S) Серин UAU (Tyr/Y) Тирозин UGU (Cys/C) Цистеин U
UUC UCC UAC UGC C
UUA (Leu/L) Лейцин UCA UAA Стоп (Охра) UGA Стоп (Опал) A
UUG UCG UAG Стоп (Янтарь) UGG (Trp/W) Триптофан     G
C CUU CCU (Pro/P) Пролин CAU (His/H) Гистидин CGU (Arg/R) Аргинин U
CUC CCC CAC CGC C
CUA CCA CAA (Gln/Q) Глутамин CGA A
CUG CCG CAG CGG G
A AUU (Ile/I) Изолейцин ACU (Thr/T) Треонин         AAU (Asn/N) Аспарагин AGU (Ser/S) Серин U
AUC ACC AAC AGC C
AUA ACA AAA (Lys/K) Лизин AGA (Arg/R) Аргинин A
AUG[A] (Met/M) Метионин ACG AAG AGG G
G GUU (Val/V) Валин GCU (Ala/A) Аланин GAU (Asp/D) Аспарагиновая кислота GGU (Gly/G) Глицин U
GUC GCC GAC GGC C
GUA GCA GAA (Glu/E) Глутаминовая кислота GGA A
GUG GCG GAG GGG G
A  Кодон AUG кодирует метионин и одновременно является сайтом инициации трансляции: первый кодон AUG в кодирующей области мРНК служит началом синтеза белка[1].

Расшифровка завершена в 1966 году[2].

Неканонические значения кодонов[править | править код]

По крайней мере у 16 типов организмов генетический код отличается от канонического. Например многие виды зелёных водорослей Acetabularia транслируют стандартные стоп-кодоны UAG и UAA в аминокислоту глицин, а гриб Candida интерпретирует РНК-кодон CUG не как лейцин, а как серин. А у митохондрий пекарских дрожжей (Saccharomyces cerevisiae) четыре из шести кодонов, обычно транслирующихся в лейцин, кодируют треонин.

Существование таких вариаций свидетельствует о возможной эволюции генетического кода.

Представители всех трёх доменов живых организмов иногда прочитывают стандартный стоп-кодон UGA как 21-ю аминокислоту селеноцистеин, не относящуюся к 20 стандартным. Селеноцистеин образуется при химической модификации серина на стадии, когда последний ещё не отсоединился от тРНК в составе рибосомы.

Аналогично у представителей двух доменов (архебактерий и бактерий) стоп-кодон UAG прочитывается как 22-я аминокислота пирролизин.

Отличия от универсального кода имеются и в митохондриальной ДНК (см. раздел Особенности).

См. также[править | править код]

  • Антикодон
  • Терминаторный кодон

Примечания[править | править код]

  1. Nakamoto T. Evolution and the universality of the mechanism of initiation of protein synthesis. (англ.) // Gene. — 2009. — 1 March (vol. 432, no. 1-2). — P. 1—6. — doi:10.1016/j.gene.2008.11.001. — PMID 19056476. [исправить]
  2. Айала Ф. Д. Современная генетика. 1987.

This is a featured list. Click here for more information.

From Wikipedia, the free encyclopedia

A circular diagram is separated into three rings, broken down into sections labeled with the letters: G, U, A, and C. Each represents a nucleotide found in RNA.

The standard RNA codon table organized in a wheel

A codon table can be used to translate a genetic code into a sequence of amino acids.[1][2] The standard genetic code is traditionally represented as an RNA codon table, because when proteins are made in a cell by ribosomes, it is messenger RNA (mRNA) that directs protein synthesis.[2][3] The mRNA sequence is determined by the sequence of genomic DNA.[4] In this context, the standard genetic code is referred to as translation table 1.[3] It can also be represented in a DNA codon table. The DNA codons in such tables occur on the sense DNA strand and are arranged in a 5′-to-3′ direction. Different tables with alternate codons are used depending on the source of the genetic code, such as from a cell nucleus, mitochondrion, plastid, or hydrogenosome.[5]

There are 64 different codons in the genetic code and the below tables; most specify an amino acid.[6] Three sequences, UAG, UGA, and UAA, known as stop codons,[note 1] do not code for an amino acid but instead signal the release of the nascent polypeptide from the ribosome.[7] In the standard code, the sequence AUG—read as methionine—can serve as a start codon and, along with sequences such as an initiation factor, initiates translation.[3][8][9] In rare instances, start codons in the standard code may also include GUG or UUG; these codons normally represent valine and leucine, respectively, but as start codons they are translated as methionine or formylmethionine.[3][9]

The first table—the standard table—can be used to translate nucleotide triplets into the corresponding amino acid or appropriate signal if it is a start or stop codon. The second table, appropriately called the inverse, does the opposite: it can be used to deduce a possible triplet code if the amino acid is known. As multiple codons can code for the same amino acid, the International Union of Pure and Applied Chemistry’s (IUPAC) nucleic acid notation is given in some instances.

Translation table 1[edit]

Standard RNA codon table[edit]

Amino-acid biochemical properties Nonpolar Up-arrow Polar dagger Basic double-dagger Acidic ↓ Termination: stop codon * Initiation: possible start codon →
Standard genetic code[1][10]

1st
base
2nd base 3rd
base
U C A G
U UUU (Phe/F) Phenylalanine Up-arrow UCU (Ser/S) Serine dagger UAU (Tyr/Y) Tyrosine dagger UGU (Cys/C) Cysteine dagger U
UUC UCC UAC UGC C
UUA (Leu/L) Leucine Up-arrow UCA UAA Stop (Ochre) *[note 2] UGA Stop (Opal) *[note 2] A
UUG → UCG UAG Stop (Amber) *[note 2] UGG (Trp/W) Tryptophan Up-arrow G
C CUU CCU (Pro/P) Proline Up-arrow CAU (His/H) Histidine double-dagger CGU (Arg/R) Arginine double-dagger U
CUC CCC CAC CGC C
CUA CCA CAA (Gln/Q) Glutamine dagger CGA A
CUG CCG CAG CGG G
A AUU (Ile/I) Isoleucine Up-arrow ACU (Thr/T) Threonine dagger AAU (Asn/N) Asparagine dagger AGU (Ser/S) Serine dagger U
AUC ACC AAC AGC C
AUA ACA AAA (Lys/K) Lysine double-dagger AGA (Arg/R) Arginine double-dagger A
AUG → (Met/M) Methionine Up-arrow ACG AAG AGG G
G GUU (Val/V) Valine Up-arrow GCU (Ala/A) Alanine Up-arrow GAU (Asp/D) Aspartic acid ↓ GGU (Gly/G) Glycine Up-arrow U
GUC GCC GAC GGC C
GUA GCA GAA (Glu/E) Glutamic acid ↓ GGA A
GUG → GCG GAG GGG G

Inverse RNA codon table[edit]

Inverse table for the standard genetic code (compressed using IUPAC notation)[13]

Amino acid RNA codons Compressed Amino acid RNA codons Compressed
Ala, A GCU, GCC, GCA, GCG GCN Ile, I AUU, AUC, AUA AUH
Arg, R CGU, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG CGN, AGR; or
CGY, MGR
Leu, L CUU, CUC, CUA, CUG; UUA, UUG CUN, UUR; or
CUY, YUR
Asn, N AAU, AAC AAY Lys, K AAA, AAG AAR
Asp, D GAU, GAC GAY Met, M AUG
Asn or Asp, B AAU, AAC; GAU, GAC RAY Phe, F UUU, UUC UUY
Cys, C UGU, UGC UGY Pro, P CCU, CCC, CCA, CCG CCN
Gln, Q CAA, CAG CAR Ser, S UCU, UCC, UCA, UCG; AGU, AGC UCN, AGY
Glu, E GAA, GAG GAR Thr, T ACU, ACC, ACA, ACG ACN
Gln or Glu, Z CAA, CAG; GAA, GAG SAR Trp, W UGG
Gly, G GGU, GGC, GGA, GGG GGN Tyr, Y UAU, UAC UAY
His, H CAU, CAC CAY Val, V GUU, GUC, GUA, GUG GUN
START AUG STOP UAA, UGA, UAG URA, UAR

Standard DNA codon table[edit]

Amino-acid biochemical properties Nonpolar Up-arrow Polar dagger Basic double-dagger Acidic ↓ Termination: stop codon * Initiation: possible start codon →
Standard genetic code[14][note 3]

1st
base
2nd base 3rd
base
T C A G
T TTT (Phe/F) Phenylalanine Up-arrow TCT (Ser/S) Serine dagger TAT (Tyr/Y) Tyrosine dagger TGT (Cys/C) Cysteine dagger T
TTC TCC TAC TGC C
TTA (Leu/L) Leucine Up-arrow TCA TAA Stop (Ochre) *[note 2] TGA Stop (Opal) *[note 2] A
TTG → TCG TAG Stop (Amber) *[note 2] TGG (Trp/W) Tryptophan Up-arrow G
C CTT CCT (Pro/P) Proline Up-arrow CAT (His/H) Histidine double-dagger CGT (Arg/R) Arginine double-dagger T
CTC CCC CAC CGC C
CTA CCA CAA (Gln/Q) Glutamine dagger CGA A
CTG CCG CAG CGG G
A ATT (Ile/I) Isoleucine Up-arrow ACT (Thr/T) Threonine dagger AAT (Asn/N) Asparagine dagger AGT (Ser/S) Serine dagger T
ATC ACC AAC AGC C
ATA ACA AAA (Lys/K) Lysine double-dagger AGA (Arg/R) Arginine double-dagger A
ATG → (Met/M) Methionine Up-arrow ACG AAG AGG G
G GTT (Val/V) Valine Up-arrow GCT (Ala/A) Alanine Up-arrow GAT (Asp/D) Aspartic acid ↓ GGT (Gly/G) Glycine Up-arrow T
GTC GCC GAC GGC C
GTA GCA GAA (Glu/E) Glutamic acid ↓ GGA A
GTG → GCG GAG GGG G

Inverse DNA codon table[edit]

Inverse table for the standard genetic code (compressed using IUPAC notation)[13]

Amino acid DNA codons Compressed Amino acid DNA codons Compressed
Ala, A GCT, GCC, GCA, GCG GCN Ile, I ATT, ATC, ATA ATH
Arg, R CGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG CGN, AGR; or
CGY, MGR
Leu, L CTT, CTC, CTA, CTG; TTA, TTG CTN, TTR; or
CTY, YTR
Asn, N AAT, AAC AAY Lys, K AAA, AAG AAR
Asp, D GAT, GAC GAY Met, M ATG
Asn or Asp, B AAT, AAC; GAT, GAC RAY Phe, F TTT, TTC TTY
Cys, C TGT, TGC TGY Pro, P CCT, CCC, CCA, CCG CCN
Gln, Q CAA, CAG CAR Ser, S TCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGC TCN, AGY
Glu, E GAA, GAG GAR Thr, T ACT, ACC, ACA, ACG ACN
Gln or Glu, Z CAA, CAG; GAA, GAG SAR Trp, W TGG
Gly, G GGT, GGC, GGA, GGG GGN Tyr, Y TAT, TAC TAY
His, H CAT, CAC CAY Val, V GTT, GTC, GTA, GTG GTN
START ATG STOP TAA, TGA, TAG TRA, TAR

Alternative codons in other translation tables[edit]

The genetic code was once believed to be universal:[16] a codon would code for the same amino acid regardless of the organism or source. However, it is now agreed that the genetic code evolves,[17] resulting in discrepancies in how a codon is translated depending on the genetic source.[16][17] For example, in 1981, it was discovered that the use of codons AUA, UGA, AGA and AGG by the coding system in mammalian mitochondria differed from the universal code.[16] Stop codons can also be affected: in ciliated protozoa, the universal stop codons UAA and UAG code for glutamine.[17][note 4] The following table displays these alternative codons.

Amino-acid biochemical properties Nonpolar Up-arrow Polar dagger Basic double-dagger Acidic ↓ Termination: stop codon *
Comparison between codon translations with alternative and standard genetic codes[3]

Code Translation
table
DNA codon involved RNA codon involved Translation
with this code
Standard translation Notes
Standard 1 Includes translation table 8 (plant chloroplasts).
Vertebrate mitochondrial 2 AGA AGA Stop * Arg (R) double-dagger
AGG AGG Stop * Arg (R) double-dagger
ATA AUA Met (M) Up-arrow Ile (I) Up-arrow
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
Yeast mitochondrial 3 ATA AUA Met (M) Up-arrow Ile (I) Up-arrow
CTT CUU Thr (T) dagger Leu (L) Up-arrow
CTC CUC Thr (T) dagger Leu (L) Up-arrow
CTA CUA Thr (T) dagger Leu (L) Up-arrow
CTG CUG Thr (T) dagger Leu (L) Up-arrow
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
CGA CGA absent Arg (R) double-dagger
CGC CGC absent Arg (R) double-dagger
Mold, protozoan, and coelenterate mitochondrial + Mycoplasma / Spiroplasma 4 TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop * Includes the translation table 7 (kinetoplasts).
Invertebrate mitochondrial 5 AGA AGA Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger
AGG AGG Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger
ATA AUA Met (M) Up-arrow Ile (I) Up-arrow
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
Ciliate, dasycladacean and Hexamita nuclear 6 TAA UAA Gln (Q) dagger Stop *
TAG UAG Gln (Q) dagger Stop *
Echinoderm and flatworm mitochondrial 9 AAA AAA Asn (N) dagger Lys (K) double-dagger
AGA AGA Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger
AGG AGG Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
Euplotid nuclear 10 TGA UGA Cys (C) dagger Stop *
Bacterial, archaeal and plant plastid 11 See translation table 1.
Alternative yeast nuclear 12 CTG CUG Ser (S) dagger Leu (L) Up-arrow
Ascidian mitochondrial 13 AGA AGA Gly (G) Up-arrow Arg (R) double-dagger
AGG AGG Gly (G) Up-arrow Arg (R) double-dagger
ATA AUA Met (M) Up-arrow Ile (I) Up-arrow
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
Alternative flatworm mitochondrial 14 AAA AAA Asn (N) dagger Lys (K) double-dagger
AGA AGA Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger
AGG AGG Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger
TAA UAA Tyr (Y) dagger Stop *
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
Blepharisma nuclear 15 TAG UAG Gln (Q) dagger Stop * As of Nov. 18, 2016: absent from the NCBI update. Similar to translation table 6.
Chlorophycean mitochondrial 16 TAG UAG Leu (L) Up-arrow Stop *
Trematode mitochondrial 21 TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
ATA AUA Met (M) Up-arrow Ile (I) Up-arrow
AGA AGA Ser (S) Arg (R) double-dagger
AGG AGG Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger
AAA AAA Asn (N) dagger Lys (K) double-dagger
Scenedesmus obliquus mitochondrial 22 TCA UCA Stop * Ser (S) dagger
TAG UAG Leu (L) Up-arrow Stop *
Thraustochytrium mitochondrial 23 TTA UUA Stop * Leu (L) Up-arrow Similar to translation table 11.
Pterobranchia mitochondrial 24 AGA AGA Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger
AGG AGG Lys (K) double-dagger Arg (R) double-dagger
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
Candidate division SR1 and Gracilibacteria 25 TGA UGA Gly (G) Up-arrow Stop *
Pachysolen tannophilus nuclear 26 CTG CUG Ala (A) Up-arrow Leu (L) Up-arrow
Karyorelict nuclear 27 TAA UAA Gln (Q) dagger Stop *
TAG UAG Gln (Q) dagger Stop *
TG UGA Stop * or Trp (W) Up-arrow Stop *
Condylostoma nuclear 28 TAA UAA Stop * or Gln (Q) dagger Stop *
TAG UAG Stop * or Gln (Q) dagger Stop *
TGA UGA Stop * or Trp (W) Up-arrow Stop *
Mesodinium nuclear 29 TAA UAA Tyr (Y) dagger Stop *
TAG UAG Tyr (Y) dagger Stop *
Peritrich nuclear 30 TA UAA Glu (E) ↓ Stop *
TAG UAG Glu (E) ↓ Stop *
Blastocrithidia nuclear 31 TAA UAA Stop * or Glu (E) ↓ Stop *
TAG UAG Stop * or Glu (E) ↓ Stop *
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *
Cephalodiscidae mitochondrial code 33 AGA AGA Ser (S) dagger Arg (R) double-dagger Similar to translation table 24.
AGG AGG Lys (K) double-dagger Arg (R) double-dagger
TAA UAA Tyr (Y) dagger Stop *
TGA UGA Trp (W) Up-arrow Stop *

See also[edit]

  • Bioinformatics
  • List of genetic codes

Notes[edit]

  1. ^ Each stop codon has a specific name: UAG is amber, UGA is opal or umber, and UAA is ochre.[7] In DNA, these stop codons are TAG, TGA, and TAA, respectively.
  2. ^ a b c d e f The historical basis for designating the stop codons as amber, ochre and opal is described in the autobiography of Sydney Brenner[11] and in a historical article by Bob Edgar.[12]
  3. ^ The major difference between DNA and RNA is that thymine (T) is only found in the former. In RNA, it is replaced with uracil (U).[15] This is the only difference between the standard RNA codon table and the standard DNA codon table.
  4. ^ Euplotes octacarinatus is an exception.[17]

References[edit]

  1. ^ a b “Amino Acid Translation Table”. Oregon State University. Archived from the original on 29 May 2020. Retrieved 2 December 2020.
  2. ^ a b Bartee, Lisa; Brook, Jack. MHCC Biology 112: Biology for Health Professions. Open Oregon. p. 42. Archived from the original on 6 December 2020. Retrieved 6 December 2020.
  3. ^ a b c d e Elzanowski A, Ostell J (7 January 2019). “The Genetic Codes”. National Center for Biotechnology Information. Archived from the original on 9 October 2020. Retrieved 21 February 2019.
  4. ^ “RNA Functions”. Scitable. Nature Education. Archived from the original on 18 October 2008. Retrieved 5 January 2021.
  5. ^ “The Genetic Codes”. National Center for Biotechnology Information. Archived from the original on 13 May 2011. Retrieved 2 December 2020.
  6. ^ “Codon”. National Human Genome Research Institute. Archived from the original on 22 October 2020. Retrieved 10 October 2020.
  7. ^ a b Maloy S. (29 November 2003). “How nonsense mutations got their names”. Microbial Genetics Course. San Diego State University. Archived from the original on 23 September 2020. Retrieved 10 October 2020.
  8. ^ Hinnebusch AG (2011). “Molecular Mechanism of Scanning and Start Codon Selection in Eukaryotes”. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 75 (3): 434–467. doi:10.1128/MMBR.00008-11. PMC 3165540. PMID 21885680.
  9. ^ a b Touriol C, Bornes S, Bonnal S, Audigier S, Prats H, Prats AC, Vagner S (2003). “Generation of protein isoform diversity by alternative initiation of translation at non-AUG codons”. Biology of the Cell. 95 (3–4): 169–78. doi:10.1016/S0248-4900(03)00033-9. PMID 12867081.
  10. ^ “The Information in DNA Determines Cellular Function via Translation”. Scitable. Nature Education. Archived from the original on 23 September 2017. Retrieved 5 December 2020.
  11. ^ Brenner, Sydney; Wolpert, Lewis (2001). A Life in Science. Biomed Central Limited. pp. 101–104. ISBN 9780954027803.
  12. ^ Edgar B (2004). “The genome of bacteriophage T4: an archeological dig”. Genetics. 168 (2): 575–82. doi:10.1093/genetics/168.2.575. PMC 1448817. PMID 15514035. see pages 580–581
  13. ^ a b IUPAC—IUB Commission on Biochemical Nomenclature. “Abbreviations and Symbols for Nucleic Acids, Polynucleotides and Their Constituents” (PDF). International Union of Pure and Applied Chemistry. Retrieved 5 December 2020.
  14. ^ “What does DNA do?”. Your Genome. Welcome Genome Campus. Archived from the original on 29 November 2020. Retrieved 12 January 2021.
  15. ^ “Genes”. DNA, Genetics, and Evolution. Boston University. Archived from the original on 28 April 2020. Retrieved 10 December 2020.
  16. ^ a b c Osawa, A (November 1993). “Evolutionary changes in the genetic code”. Comparative Biochemistry and Physiology. 106 (2): 489–94. doi:10.1016/0305-0491(93)90122-l. PMID 8281749.
  17. ^ a b c d Osawa S, Jukes TH, Watanabe K, Muto A (March 1992). “Recent evidence for evolution of the genetic code”. Microbiological Reviews. 56 (1): 229–64. doi:10.1128/MR.56.1.229-264.1992. PMC 372862. PMID 1579111.

Further reading[edit]

  • Chevance FV, Hughes KT (2 May 2017). “Case for the genetic code as a triplet of triplets”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 114 (18): 4745–4750. doi:10.1073/pnas.1614896114. JSTOR 26481868. PMC 5422812. PMID 28416671.
  • Dever TE (29 June 2012). “A New Start for Protein Synthesis”. Science. American Association for the Advancement of Science. 336 (6089): 1645–1646. Bibcode:2012Sci…336.1645D. doi:10.1126/science.1224439. JSTOR 41585146. PMID 22745408. S2CID 44326947. Retrieved 17 October 2020.
  • Gardner RS, Wahba AJ, Basilio C, Miller RS, Lengyel P, Speyer JF (December 1962). “Synthetic polynucleotides and the amino acid code. VII”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 48 (12): 2087–2094. Bibcode:1962PNAS…48.2087G. doi:10.1073/pnas.48.12.2087. PMC 221128. PMID 13946552.
  • Nakamoto T (March 2009). “Evolution and the universality of the mechanism of initiation of protein synthesis”. Gene. 432 (1–2): 1–6. doi:10.1016/j.gene.2008.11.001. PMID 19056476.
  • Wahba AJ, Gardner RS, Basilio C, Miller RS, Speyer JF, Lengyel P (January 1963). “Synthetic polynucleotides and the amino acid code. VIII”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 49 (1): 116–122. Bibcode:1963PNAS…49..116W. doi:10.1073/pnas.49.1.116. PMC 300638. PMID 13998282.
  • Yanofsky C (9 March 2007). “Establishing the Triplet Nature of the Genetic Code”. Cell. 128 (5): 815–818. doi:10.1016/j.cell.2007.02.029. PMID 17350564. S2CID 14249277.
  • Zaneveld J, Hamady M, Sueoka N, Knight R (28 February 2009). “CodonExplorer: An Interactive Online Database for the Analysis of Codon Usage and Sequence Composition”. Bioinformatics for DNA Sequence Analysis. Methods in Molecular Biology. Vol. 537. pp. 207–232. doi:10.1007/978-1-59745-251-9_10. ISBN 978-1-58829-910-9. PMC 2953947. PMID 19378146.

External links[edit]

  • DNA codon chart organized in a wheel

Добавить комментарий